Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms