Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms