Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms