Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms