Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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