Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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