Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms