Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SS18Q15532 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SS18Q15532 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SS18Q15532 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SS18Q15532 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SS18Q15532 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SS18Q15532 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SS18Q15532 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SS18Q15532 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SS18Q15532 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SS18Q15532 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SS18Q15532 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SS18Q15532 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SS18Q15532 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SS18Q15532 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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