Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NCF4Q15080 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NCF4Q15080 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NCF4Q15080 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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