Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms