Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms