Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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