Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TOP3AQ13472 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms