Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms