Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 MCPH1-207ENST00000522905 2049 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ARHGAP36-203ENST00000370922 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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UBE2V1Q13404 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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UBE2V1Q13404 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SMAP1-203ENST00000370455 3333 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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UBE2V1Q13404 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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UBE2V1Q13404 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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UBE2V1Q13404 LINC01588-203ENST00000529902 4279 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SLC2A5-202ENST00000377424 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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