Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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