Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPRL3Q12980 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms