Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANK3Q12955 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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