Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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