Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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BPTFQ12830 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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BPTFQ12830 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BPTFQ12830 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPTFQ12830 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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