Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RAB40BQ12829 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RAB40BQ12829 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RAB40BQ12829 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB40BQ12829 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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