Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TWF1Q12792 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TWF1Q12792 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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TWF1Q12792 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TWF1Q12792 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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TWF1Q12792 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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