Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SREBF2Q12772 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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