Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms