Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms