Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms