Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms