Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms