Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms