Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms