Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms