Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P62684 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms