Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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