Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSCP56915 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSCP56915 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GSCP56915 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms