Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEMP55040 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEMP55040 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEMP55040 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GEMP55040 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GEMP55040 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEMP55040 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEMP55040 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEMP55040 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEMP55040 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEMP55040 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEMP55040 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEMP55040 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GEMP55040 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEMP55040 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEMP55040 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEMP55040 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GEMP55040 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms