Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIRAP54198 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIRAP54198 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIRAP54198 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIRAP54198 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HIRAP54198 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HIRAP54198 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIRAP54198 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIRAP54198 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIRAP54198 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIRAP54198 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIRAP54198 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIRAP54198 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIRAP54198 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIRAP54198 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms