Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJA8P48165 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms