Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms