Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms