Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms