Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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