Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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