Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms