Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DPA1P20036 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DPA1P20036 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DPA1P20036 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DPA1P20036 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DPA1P20036 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DPA1P20036 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DPA1P20036 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DPA1P20036 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DPA1P20036 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DPA1P20036 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DPA1P20036 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DPA1P20036 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms