Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB6P18564 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB6P18564 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms