Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DESP17661 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms