Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA1P17302 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA1P17302 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA1P17302 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA1P17302 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA1P17302 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA1P17302 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA1P17302 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA1P17302 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA1P17302 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA1P17302 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms