Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms