Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFTRP13569 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFTRP13569 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFTRP13569 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFTRP13569 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFTRP13569 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFTRP13569 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFTRP13569 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CFTRP13569 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFTRP13569 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFTRP13569 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFTRP13569 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFTRP13569 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms