Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP3P12645 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP3P12645 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP3P12645 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMP3P12645 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMP3P12645 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMP3P12645 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMP3P12645 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMP3P12645 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms